AI首次用于设计新病毒,成功制造出16种噬菌体

雅加达 - 人工智能或AI现在正在进入生物学领域。美国科学家首次使用生成式AI设计了一种在自然界中未发现的新病毒。

Anadolu Agency于8月7日星期五援引报道,该研究由加利福尼亚州斯坦福大学和Arc Institute的科学家进行。结果发表在科学杂志上。

研究人员使用训练有数百万自然基因组的生成式 AI 模型来设计完整的噬菌体。

噬菌体是一种感染细菌的病毒,可以在细菌中自我复制。而基因组是携带生物信息的整个遗传物质。

在这项研究中,科学家使用了两种基因组语言模型,称为Evo 1和Evo 2。

它的工作方式类似于用于生成式AI的大型语言模型或LLM。不同之处在于,Evo 1和Evo 2不预测单词序列,而是基因序列。

训练数据来自病毒、细菌甚至更复杂的生物体的基因组,如植物和动物。

研究人员随后化学合成了近300个基因组,并在实验室中进行了测试。

该实验产生了16种工程噬菌体,其序列、结构以及生存和繁殖能力各不相同。

在测试中,这种工程噬菌体在杀死大肠杆菌方面比作为对照的天然病毒更有效。

Anadolu Agency援引的一项研究称,这种方法可以扩展合成基因组学的能力,即设计或人工组装遗传物质的领域。

研究人员还看到了使用这种方法开发噬菌体疗法的机会,即利用噬菌体对抗致病细菌。

“我们的方法扩展了合成基因组学可以实现的,为适应性噬菌体疗法铺平了道路,这种疗法可以抵抗快速发展的病原体,并为更大,更复杂的基因组设计奠定了基础,”研究人员写道。

他们表示,这项研究仍处于早期阶段。未来可以开发类似的方法来对更大的生物系统进行基因组排序和合成,并开发治疗方法。