オミクロンを検出できると言うPCR0+とは何ですか?

写真:ムフィド・マジヌン・オン・アンスプラッシュ

ジャカルタ - ウイルス学者のアンディ・ウタマ博士は、ウイルスはCOVID-19を含む生存本能を再現し、持つことができるので、生き物であると説明しました。繁殖する場所がある限り、宿主に依存するウイルスは常に突然変異によって進化する。

「ウイルスが繁殖する機会を持っている限り、突然変異プロセスは引き続き起こります。さらに、このウイルスの遺伝物質はRNAであり、RNA突然変異はDNAよりもはるかに速い」と、InnolabのKalGenラボディレクターは2月6日(日曜日)にアンタラが報告した声明の中で述べた。

彼は、様々な突然変異、すなわちウイルスに利益をもたらすものとそれに害を与える突然変異があると言いました。突然変異が好ましくない場合、ウイルスは消失します。オミクロンはウイルス自体の利益のために生き残ることができた突然変異の結果であるが、

追跡プロセスは単純ではありません。ウイルスを検出する開発の基本的な概念は、その対象物が遺伝物質であるため、2つの方法があります。まず、SARS-CoV-2 に固有のウイルスの一意の部分を探します。次に、簡単に変更できない領域 (持続可能) を選択します。

バイオインフォマティクスを含む高度な技術は、omicron変異体の検出を支援する上で非常に重要な役割を果たします。何十万ものウイルスゲノムデータを並べ、持続可能なゲノムの一部を探すことができるソフトウェアがあります。

「PCRは特定の小さな部品を検出します。WGC(全ゲノムシーケンシング)は、すべてのウイルスゲノムを特定し、その結果は時間とコストがかかります。しかし、それがどのような変種であるかを判断するために、結果は大丈夫です。PCRの場合、特定の選択された部品を含む持続可能な部品のみを探しています」とAndi氏は述べています。

国立感染症研究所ウイルス学科2で研究を行った日本の卒業生は、オミクロン変異体を検出する方法が2つあることを強調した。いずれも2021年のインドネシア保健省(Kemenkes)からの回覧状に基づいています。

「まず、STGF(S-遺伝子標的障害)は、当初からオリジナルウイルスの設計がなされたため検出できないGen Sを探すことをコンセプトにしています。この場合、オミクロン以外の可能な変種があるでしょう」と、彼が言いました。

もう一つのアプローチは、ポイント突然変異を直接標的とするSNP(一塩基多型)であるため、オミクロン変異に非常に近い。この方法は、日本の豊田通商公団と健康科学研究所と共同で、診断検査を行っているカルベ・ファルマの子会社であるカルゲン・インノラボで行われています。

「2番目のメソッド(SNP)をO+PCRと呼びます。私たちがターゲットにしているので、すでにターゲットまたはより具体的です。また、元の3つの遺伝子を用い、エラーの可能性を最小限に抑えました。しかし、私は強調しますが、我々はそのすべてを保証するためのゴールドスタンダードがWGSであることに同意します」と、アンディが説明しました。

「どのキットを使用するかを決める前に、まず、データ、データの一貫性を確認します。ちなみに、私たちが選んだキットはWGSと比較されたデータを持っています。したがって、それは100パーセントのデータを示し、疑わしいオミクロンを予測する上で非常に一貫しています」と、彼が付け加えました。