ما هو PCR 0 + التي تقول أنه يمكن الكشف عن أوميكرون؟
جاكرتا - أوضح عالم الفيروسات أندي أوتاما، الحاصل على درجة الدكتوراه، أن الفيروسات هي أشياء حية، لأنها يمكن أن تتكاثر ويكون لها غريزة البقاء على قيد الحياة، بما في ذلك COVID-19. طالما أن هناك مكانا للتكاثر ، فإن الفيروسات التي تعتمد بشكل كبير على مضيفيهم تتطور دائما من خلال الطفرة.
"ما دام الفيروس لديه الفرصة للتكاثر، فإن عملية الطفرة ستستمر في الحدوث. وعلاوة على ذلك، فإن المادة الوراثية لهذا الفيروس هي الحمض النووي الريبي، حيث الطفرات الحمض النووي الريبي هي أسرع بكثير من الحمض النووي"، وقال مدير مختبر كالغن Innolab في بيانه، الأحد، 6 فبراير، التي ذكرتها أنتارا.
وقال إن هناك طفرات مختلفة، وهي تلك التي تفيد الفيروس وتلك التي تضر به. إذا كانت الطفرة غير مواتية، فإن الفيروس سوف يختفي. في حين أن الأوميكرون هو نتيجة للطفرات التي تمكنت من البقاء على قيد الحياة لصالح الفيروس نفسه.
عملية التتبع ليست بسيطة. المفهوم الأساسي لتطوير الكشف عن الفيروسات لأن الكائن هو مادة وراثية ، ثم هناك طريقتان يمكن القيام به. أولا، ابحث عن جزء فريد من الفيروس خاص بالسارس-CoV-2. ثانيا، اختر منطقة لا يمكن تغييرها بسهولة (مستدامة).
التكنولوجيا المتطورة، بما في ذلك المعلوماتية الحيوية، تلعب دورا هاما جدا في المساعدة على الكشف عن المتغيرات أوميكرون. هناك برامج قادرة على تجميع مئات الآلاف من بيانات الجينوم الفيروسي والبحث عن أجزاء من الجينوم مستدامة.
"PCR يكشف أجزاء صغيرة محددة. يحدد WGC (تسلسل الجينوم الكامل) جميع الجينوم الفيروسي ، وعواقبه تستغرق وقتا طويلا ومكلفة. ولكن لتحديد ما هو البديل ، والنتيجة على ما يرام. بالنسبة ل PCR ، ابحث فقط عن أجزاء مستدامة مع أجزاء مختارة معينة".
ثم أكد الخريج الياباني الذي أجرى أبحاثا في قسم علم الفيروسات 2، المعهد الوطني للأمراض المعدية، أن هناك طريقتين للكشف عن متغيرات الأمكرون. ويستند كلاهما إلى رسالة دائرية من وزارة الصحة الإندونيسية (Kemenkes) في عام 2021.
"أولا، STGF (S-جين الهدف الفشل)، والمفهوم هو للبحث عن الجنرال S التي لا يمكن الكشف عنها لأنه منذ البداية تم تصميم للفيروس الأصلي. وفي هذه الحالة، ستكون هناك بدائل محتملة غير أوميكرون".
نهج آخر هو SNP (تعدد الأشكال النيوكليوتيدية الفردية) ، والذي يستهدف مباشرة طفرة النقطة ، لذلك فهو قريب جدا من متغير الأوميكرون. يتم تنفيذ هذه الطريقة في KalGen Innolab ، وهي شركة تابعة لشركة Kalbe Farma التي تشارك في الفحوصات التشخيصية ، بالتعاون مع شركة تويوتا تسوشو والمعهد العلمي الصحي في اليابان.
"نحن ندعو الأسلوب الثاني (SNP) O + PCR. مستهدفة بالفعل أو أكثر تحديدا لأننا استهدفنا. بالإضافة إلى ذلك، استخدمنا الجينات الثلاثة الأصلية، وبالتالي تقليل احتمال الأخطاء. لكنني أؤكد أننا نتفق على أن المعيار الذهبي لضمان كل ذلك هو WGS".
"قبل أن تقرر أي مجموعة لاستخدامها، ندرس أولا، انظر البيانات، واتساق البيانات. وبالمناسبة، فإن المجموعة التي اخترناها تحتوي على بيانات تمت مقارنتها مع WGS. لذا ، فإنه يظهر بيانات 100 في المئة ومتسقة تماما في التنبؤ أوميكرون المشتبه فيه ".